Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms