Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F3Q08477 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms