Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms