Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CXCL9Q07325 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CXCL9Q07325 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms