Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PAX8Q06710 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms