Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms