Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
ERCC6Q03468 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms