Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms