Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms