Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDC42EP1Q00587 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms