Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFM1P61960 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UFM1P61960 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UFM1P61960 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UFM1P61960 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UFM1P61960 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UFM1P61960 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
UFM1P61960 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFM1P61960 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms