Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLE2P56282 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLE2P56282 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLE2P56282 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLE2P56282 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLE2P56282 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLE2P56282 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLE2P56282 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLE2P56282 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLE2P56282 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLE2P56282 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLE2P56282 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLE2P56282 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLE2P56282 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLE2P56282 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLE2P56282 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLE2P56282 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLE2P56282 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms