Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KPNA1P52294 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KPNA1P52294 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KPNA1P52294 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KPNA1P52294 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KPNA1P52294 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KPNA1P52294 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KPNA1P52294 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KPNA1P52294 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KPNA1P52294 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KPNA1P52294 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KPNA1P52294 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KPNA1P52294 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KPNA1P52294 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KPNA1P52294 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KPNA1P52294 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KPNA1P52294 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KPNA1P52294 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KPNA1P52294 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms