Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCA4P51532 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms