Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IDH3AP50213 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms