Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRPC1P48995 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC1P48995 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms