Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSBP45954 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms