Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETFBP38117 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETFBP38117 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETFBP38117 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETFBP38117 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETFBP38117 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETFBP38117 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETFBP38117 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETFBP38117 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ETFBP38117 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETFBP38117 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETFBP38117 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETFBP38117 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ETFBP38117 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETFBP38117 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETFBP38117 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETFBP38117 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETFBP38117 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETFBP38117 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETFBP38117 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETFBP38117 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETFBP38117 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETFBP38117 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETFBP38117 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ETFBP38117 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETFBP38117 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETFBP38117 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETFBP38117 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ETFBP38117 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ETFBP38117 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETFBP38117 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETFBP38117 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETFBP38117 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETFBP38117 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ETFBP38117 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETFBP38117 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETFBP38117 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETFBP38117 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETFBP38117 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETFBP38117 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETFBP38117 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETFBP38117 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETFBP38117 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ETFBP38117 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ETFBP38117 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETFBP38117 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETFBP38117 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETFBP38117 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETFBP38117 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETFBP38117 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ETFBP38117 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms