Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX11P35716 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX11P35716 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX11P35716 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms