Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms