Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD10P28358 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms