Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB4P28070 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms