Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NFKBIAP25963 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms