Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCR1P25024 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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