Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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