Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIG1P18858 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIG1P18858 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIG1P18858 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIG1P18858 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LIG1P18858 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIG1P18858 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIG1P18858 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIG1P18858 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIG1P18858 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIG1P18858 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIG1P18858 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIG1P18858 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIG1P18858 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIG1P18858 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIG1P18858 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIG1P18858 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIG1P18858 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIG1P18858 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms