Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATF3P18847 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATF3P18847 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATF3P18847 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATF3P18847 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATF3P18847 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATF3P18847 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATF3P18847 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATF3P18847 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATF3P18847 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATF3P18847 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATF3P18847 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATF3P18847 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATF3P18847 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATF3P18847 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATF3P18847 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF3P18847 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF3P18847 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF3P18847 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF3P18847 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF3P18847 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF3P18847 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF3P18847 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF3P18847 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF3P18847 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF3P18847 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF3P18847 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF3P18847 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF3P18847 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF3P18847 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF3P18847 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF3P18847 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF3P18847 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF3P18847 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF3P18847 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF3P18847 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF3P18847 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF3P18847 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF3P18847 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF3P18847 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF3P18847 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF3P18847 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF3P18847 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF3P18847 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF3P18847 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF3P18847 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF3P18847 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF3P18847 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF3P18847 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF3P18847 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF3P18847 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF3P18847 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF3P18847 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF3P18847 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF3P18847 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF3P18847 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF3P18847 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF3P18847 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF3P18847 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF3P18847 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF3P18847 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF3P18847 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF3P18847 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF3P18847 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF3P18847 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF3P18847 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF3P18847 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF3P18847 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF3P18847 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF3P18847 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms