Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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PTPRAP18433 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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PTPRAP18433 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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PTPRAP18433 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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PTPRAP18433 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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PTPRAP18433 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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