Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CREB1P16220 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CREB1P16220 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB1P16220 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB1P16220 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB1P16220 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB1P16220 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB1P16220 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB1P16220 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB1P16220 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB1P16220 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB1P16220 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB1P16220 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB1P16220 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB1P16220 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB1P16220 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB1P16220 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB1P16220 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB1P16220 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB1P16220 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB1P16220 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB1P16220 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB1P16220 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB1P16220 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB1P16220 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CREB1P16220 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms