Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTHFD1P11586 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms