Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNB1P11230 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms