Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms