Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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PTPRCP08575 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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PTPRCP08575 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
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PTPRCP08575 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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PTPRCP08575 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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PTPRCP08575 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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