Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLK3P07288 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLK3P07288 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLK3P07288 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLK3P07288 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLK3P07288 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLK3P07288 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLK3P07288 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLK3P07288 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLK3P07288 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLK3P07288 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLK3P07288 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLK3P07288 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLK3P07288 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLK3P07288 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLK3P07288 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLK3P07288 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLK3P07288 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLK3P07288 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLK3P07288 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms