Protein–RNA interactions for Protein: O95025

SEMA3D, Semaphorin-3D, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3DO95025 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3DO95025 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms