Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLSTN1O94985 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms