Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPLO60437 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPLO60437 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPLO60437 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPLO60437 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPLO60437 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PPLO60437 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPLO60437 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PPLO60437 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPLO60437 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPLO60437 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPLO60437 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPLO60437 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPLO60437 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPLO60437 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPLO60437 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PPLO60437 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPLO60437 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPLO60437 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPLO60437 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPLO60437 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPLO60437 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPLO60437 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPLO60437 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPLO60437 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPLO60437 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPLO60437 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPLO60437 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPLO60437 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPLO60437 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPLO60437 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPLO60437 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPLO60437 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPLO60437 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPLO60437 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPLO60437 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPLO60437 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPLO60437 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPLO60437 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPLO60437 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPLO60437 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPLO60437 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPLO60437 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPLO60437 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPLO60437 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPLO60437 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPLO60437 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPLO60437 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPLO60437 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPLO60437 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPLO60437 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPLO60437 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPLO60437 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPLO60437 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPLO60437 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPLO60437 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPLO60437 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPLO60437 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPLO60437 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPLO60437 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPLO60437 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPLO60437 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPLO60437 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPLO60437 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPLO60437 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPLO60437 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPLO60437 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPLO60437 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPLO60437 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms