Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRTM2O43300 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRTM2O43300 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRTM2O43300 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRTM2O43300 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRTM2O43300 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRTM2O43300 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRRTM2O43300 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LRRTM2O43300 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LRRTM2O43300 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRRTM2O43300 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LRRTM2O43300 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRRTM2O43300 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRRTM2O43300 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRRTM2O43300 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LRRTM2O43300 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LRRTM2O43300 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LRRTM2O43300 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRRTM2O43300 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LRRTM2O43300 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRRTM2O43300 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRRTM2O43300 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRRTM2O43300 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LRRTM2O43300 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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LRRTM2O43300 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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LRRTM2O43300 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LRRTM2O43300 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LRRTM2O43300 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LRRTM2O43300 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LRRTM2O43300 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LRRTM2O43300 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LRRTM2O43300 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LRRTM2O43300 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LRRTM2O43300 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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