Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOC4-APOC2K7ER74 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms