Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HHLA1C9JL84 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms