Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms