Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PATL2C9JE40 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PATL2C9JE40 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms