Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-2B6SEH9 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVV-2B6SEH9 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 272.4 ms