Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SRRM4A7MD48 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SRRM4A7MD48 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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