Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GMNCA6NCL1 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms