Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAXBP1Q9Y5B6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms