Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9Y3F1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9Y3F1 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.6 ms