Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGSF9BQ9UPX0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms