Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms