Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms